neuroConstruct 1.6.0

ใบ อนุญาต: ฟรี ‎ขนาดแฟ้ม: 50.00 MB
‎คะแนนจากผู้ใช้: 3.5/5 - ‎2 ‎โหวต

neuroConstruct ได้รับการพัฒนาในห้องปฏิบัติการเงินในภาควิชาประสาทวิทยาสรีรวิทยาและเภสัชวิทยาที่ UCL neuroConstruct ได้รับการออกแบบมาเพื่อลดความซับซ้อนของการพัฒนาเครือข่ายที่ซับซ้อนของเซลล์ประสาทที่สมจริงทางชีวภาพเช่นรุ่นที่ผสมผสาน morphologies dendritic และการนําเยื่อหุ้มเซลล์ที่สมจริง มันถูกนํามาใช้ใน Java และสร้างไฟล์สคริปต์สําหรับการจําลอง NEURON และ GENESIS ด้วยการสนับสนุนแพลตฟอร์มการจําลองอื่น ๆ (รวมถึง PSICS, MOOSE และ PyNN) ในขั้นตอนขั้นสูงของการพัฒนา มันใช้ข้อมูลจําเพาะล่าสุดของ NeuroML รวมถึง MorphML, ChannelML และ NetworkML การพัฒนาซอฟต์แวร์นี้เป็นไปได้ด้วยเงินทุนจาก Wellcome Trust สภาวิจัยทางการแพทย์และโครงการ EU Synapse บางส่วนของคุณสมบัติที่สําคัญของ neuroConstruct คือ: *neuroconstructสามารถนําเข้าไฟล์สัณฐานวิทยาในปฐมกาล, neuron, neurolucida, swcและmorphmlรูปแบบสําหรับการรวมในเซลล์เดียวหรือรูปแบบเครือข่าย, หรือเซลล์นามธรรมมากขึ้นยังสามารถสร้างขึ้นด้วยตนเองของ *การสร้างเครือข่ายของเซลล์ประสาทตามการนําไฟฟ้าตําแหน่งใน3d *รูปแบบการเชื่อมต่อที่ซับซ้อนระหว่างกลุ่มเซลล์คุณสามารถระบุสําหรับเครือข่าย *สคริปต์การจําลองสามารถสร้างขึ้นสําหรับ neuron, ปฐมกาล, MOOSE, PSICS และ PyNN ตามจําลอง (หมายเหตุ: ไม่ใช่ทุกโครงการที่สามารถสร้างได้สําหรับการจําลองทุกครั้ง) * กลไกเซลลูลาร์ที่สมจริงทางชีวภาพ (synapses / กลไกช่อง) สามารถนําเข้าจากไฟล์สคริปต์ดั้งเดิม (*.mod หรือ *.g) หรือสร้างขึ้นจากเทมเพลตโดยใช้ ChannelML *การสร้างอัตโนมัติของรหัสเพื่อบันทึกข้อมูลการจําลองและการสร้างภาพ/การวิเคราะห์ของข้อมูลใน neuroConstruct *บันทึกการจําลองการทํางานสามารถดูและจัดการผ่านอินเตอร์เฟซเบราว์เซอร์จําลอง * สามารถใช้อินเทอร์เฟซสคริปต์ที่ใช้ Python เพื่อควบคุมการสร้างแบบจําลองและการดําเนินการทําให้สามารถเรียกใช้การจําลองหลายรายการสําหรับการเพิ่มประสิทธิภาพรูปแบบเซลล์และเครือข่าย

ประวัติรุ่น

  • เวอร์ชัน 1.6.0 โพสต์เมื่อ 2012-08-23

รายละเอียดหลักสูตร