โครงการ SourceForge OpenRasMol เป็นส่วนเสริมของโครงการ RasMol และ OpenrasMol http://rasmol.org หวังว่าโครงการ SourceForge OpenRasMol จะให้จุดโฟกัสที่สะดวกสําหรับการมีส่วนร่วมร่วมกันอย่างแข็งขัน คุณสมบัติ RasMol: RasMol เป็นโปรแกรมกราฟิกโมเลกุลที่มีไว้สําหรับการสร้างภาพของโปรตีนกรดนิวคลีอิกและโมเลกุลขนาดเล็ก โปรแกรมนี้มีวัตถุประสงค์เพื่อแสดงการสอนและการสร้างภาพคุณภาพการตีพิมพ์ RasMol ทํางานบนสถาปัตยกรรมและระบบปฏิบัติการที่หลากหลายรวมถึง Microsoft Windows, Apple Macintosh, UNIX และระบบ VMS รุ่น UNIX และ VMS ต้องการจอแสดงผล X Windows สี 8, 24 หรือ 32 บิต (X11R4 หรือใหม่กว่า) รุ่น X Windows ของ RasMol ให้การสนับสนุนตัวเลือกสําหรับกล่องเรียกเลขหมายฮาร์ดแวร์และการสื่อสารหน่วยความจําที่ใช้ร่วมกันเร่ง (ผ่านส่วนขยาย XInput และ MIT-SHM) ถ้ามีอยู่บนเซิร์ฟเวอร์ X ปัจจุบัน โปรแกรมอ่านในไฟล์พิกัดโมเลกุลและแสดงโมเลกุลบนหน้าจอในความหลากหลายของโทนสีและการแสดงโมเลกุล ปัจจุบันการเป็นตัวแทนที่มีอยู่รวมถึงโครงลวดลึก, แท่ง 'Dreiding' ทรงกลม spacefilling (CPK) ลูกบอลและติดริบบิ้นโมเลกุลที่เป็นของแข็งและ strand ฉลากอะตอมและพื้นผิวจุด รุ่น X Windows ของ RasMol ให้การสนับสนุนตัวเลือกสําหรับกล่องเรียกเลขหมายฮาร์ดแวร์และการสื่อสารหน่วยความจําที่ใช้ร่วมกันเร่ง (ผ่านส่วนขยาย XInput และ MIT-SHM) ถ้ามีอยู่บนเซิร์ฟเวอร์ X ปัจจุบัน โปรแกรมอ่านในไฟล์พิกัดโมเลกุลและแสดงโมเลกุลบนหน้าจอในความหลากหลายของการแสดงและโทนสี รูปแบบไฟล์อินพุตที่รองรับ ได้แก่ ธนาคารข้อมูลโปรตีน (PDB), รูปแบบการเล่นแร่แปรธาตุและ Sybyl Mol2 ของ Tripos Associates, รูปแบบการออกแบบโมเลกุล จํากัด (MDL) รูปแบบ Mol, รูปแบบ Minnesota Supercomputer Center (MSC) XYZ (XMol) รูปแบบ CHARMm, รูปแบบ CIF และไฟล์รูปแบบ mmCIF ถ้าข้อมูลการเชื่อมต่อไม่มีอยู่ในแฟ้ม นี้จะถูกคํานวณโดยอัตโนมัติ โมเลกุลที่โหลดสามารถแสดงเป็นพันธะ wireframe, พันธะติด 'Dreiding' กระบอก, การติดตามอัลฟาคาร์บอน, ทรงกลมเติมพื้นที่ (CPK) ริบบิ้น macromolecular (ทั้งริบบิ้นแข็งแรเงาเรียบหรือเส้นขนาน), พันธะไฮโดรเจนและการแสดงพื้นผิวจุด อะตอมอาจมีป้ายกํากับด้วยสตริงข้อความโดยพลการ สอดคล้องสํารองและรุ่น NMR หลายรุ่นอาจมีสีพิเศษและระบุในฉลากอะตอม ส่วนต่าง ๆ ของโมเลกุลอาจแสดงและสีเป็นอิสระจากส่วนที่เหลือของโมเลกุลหรือแสดงในหลายตัวแทนพร้อมกัน โมเลกุลที่แสดงอาจหมุนแปลซูมและ z-clipped (slabbed) แบบโต้ตอบโดยใช้เมาส์แถบเลื่อนบรรทัดคําสั่งหรือกล่องหมุนที่แนบมา RasMol สามารถอ่านรายการคําสั่งที่เตรียมไว้จากไฟล์ 'สคริปต์' (หรือผ่านการสื่อสารระหว่างกระบวนการ) เพื่อให้สามารถกู้คืนภาพหรือมุมมองที่กําหนดได้อย่างรวดเร็ว นอกจากนี้ RasMol ยังสามารถสร้างไฟล์สคริปต์ที่มีคําสั่งที่จําเป็นในการสร้างภาพปัจจุบันใหม่ ในที่สุดภาพที่แสดงผลอาจเขียนออกมาในรูปแบบที่หลากหลายรวมถึง raster หรือ Vector PostScript, GIF, PPM, BMP, PICT, Sun rasterfile หรือเป็นสคริปต์อินพุต MolScript หรือ Kinemage สิ่งอํานวยความสะดวกความช่วยเหลือของ RasMol สามารถเข้าถึงได้โดยพิมพ์ "ความช่วยเหลือ" หรือ "ความช่วยเหลือ"
ประวัติรุ่น
- เวอร์ชัน RasMol_2.7.5 โพสต์เมื่อ 2010-12-15
การแก้ไขและการอัปเดตหลายรายการ - เวอร์ชัน RasMol_2.7.5 โพสต์เมื่อ 2010-12-15
รายละเอียดหลักสูตร
- ประเภท: ศึกษา > อื่นๆ
- Publisher: www.rasmol.org
- ใบ อนุญาต: ฟรี
- ราคา: N/A
- เวอร์ชัน: 2.7.5
- แพ ลตฟอร์ม: linux